Mivel egy térinformatikai rendszerben általában az adat a legértékesebb alkotóelem, így kiemelt figyelemmel kell eljárni a tárolását és nyilvántartását illetően. Az adathordozók körültekintő megválasztása mellett az adatok biztonságáról is gondoskodni kell, így a kiindulási adatokról és a térinformatikai feldolgozás során létrejövő új adatokról a munkafolyamat fontosabb lépesei közben biztonsági másolatokat kell készíteni. A térinformatikai rendszerekben tárolt adatok három nagy csoportra oszthatók: - geometriai adatok - szakadatok (attribútumok) - metaadatok A geometriai adatok a térbeli függést határozzák meg, kapcsolatot teremtenek az adatok által leírt objektum és a tér egy pontja vagy területe között. A geometriai adatok lehetnek vektoradatok vagy raszteradatok is, közös jellemzőjük, hogy valamely vonatkoztatási rendszerben koordináták segítségével adják meg az objektum térbeli függését. A szakadatok a geometriai adatok által térben lokalizált objektum jellemzésére, tulajdonságainak kvalitatív és kvantitatív rögzítésére szolgálnak. Példa: A megyéket tartalmazó adatbázis esetén geometriai adatnak számít a megye határának EOV koordinátái, szakadatnak pedig a megye neve, a megyeszékhely neve, a megyében található települések száma és a megye lakosságának száma. A metaadatokat az adatokra vonatkozó adatokként foghatjuk fel. Nagymértékben megkönnyítik az adatokkal történő munkát, hiszen jó esetben minden szükséges információt tartalmaznak az adatállománnyal kapcsolatban, így számunkra ismeretlen adatbázist is gyorsan értelmezni és használni tudunk. A térinformatikai szoftverek többsége lehetővé teszi az adatállomány metaadatokkal történő ellátását. Gyakran használt metaadatok: - adatállomány neve - adatállomány tulajdonosa - adatállomány tulajdonosának, létrehozójának elérhetőségei - adatok forrása, felmérési, rögzítési módszere, pontossága - adatok keletkezési ideje - alkalmazott vonatkoztatási rendszer - adatbázisban használt változótípusok és az általuk felvehető értékek magyarázata

Az adathordozóhoz hasonlóan az adat formátumának megválasztása is körültekintést igényel, ugyanis az adatok hosszútávú értelmezése csak úgy biztosítható, ha az adatok időtálló formátumban kerülnek rögzítésre. A legtöbb térinformatikai szoftver lehetőséget kínál saját, zárt forrású formátumának használatára, melyet más szoftverek nem kezelnek, de általánosan elterjedt, nyílt forrású formátumokat is választhatunk, melyekhez nagyobb eséllyel találunk évekkel vagy évtizedekkel később megfelelő szoftvert, illetve szükség esetén mi magunk is írhatunk feldolgozó vagy konvertáló programot, hiszen a formátum szerkezete nyilvános.