Klinikai mikrobiológia : mátrix-asszisztált lézer deszorpciós, ionizációs, repülési idő mérésen alapuló tömegspektrometriai módszer alkalmazásának lehetőségei a klinikai mikrobiológiai gyakorlatban

Nagy Erzsébet: Klinikai mikrobiológia : mátrix-asszisztált lézer deszorpciós, ionizációs, repülési idő mérésen alapuló tömegspektrometriai módszer alkalmazásának lehetőségei a klinikai mikrobiológiai gyakorlatban. [Online oktatási csomag (e-learning lecke/téma)]

Weboldal 2/index.html Hozzáférés korlátozott: Csak SZTE eduID-val rendelkezők [Videós segédlet] Letöltés (5kB)

Absztrakt, leírás

A rutin klinikai mikrobiológiai laboratóriumok elsődleges feladata, hogy infekciós kórkép gyanúja esetén a legkülönbözőbb módszereket alkalmazva, minél előbb meghatározza a feltételezett kórokozót és annak antimikróbás szerekkel szembeni érzékenységét, ezzel segítve a klinikus terápiára vonatkozó döntését. A hagyományos módszerek legtöbbször időigényesek. A baktériumok, vagy gombák okozta infekciók során a különböző inkubációs időt igénylő tenyésztés után el kell végezni a fenotípusos tulajdonságok alapján a faj szintű (species szintű) azonosítást, valamint a rezisztencia vizsgálatot. Még a miniatürizált, automata identifikáló módszerek is az alkalmazott rendszertől függően 4-24 órás inkubációt igényelnek a preformált, vagy induktív enzimtevékenység detektálására. A nukleinsav alapú species identifikálás szintén igényli a tenyésztést, majd megfelelő műszerezettség és szaktudás segíti a riboszómális RNS gén vagy teljes genom szekvencia analízis alapján történő species meghatározást. Az eljárás idő és költségigényes. A vírus infekciók hagyományos laboratóriumi diagnózisa vagy a szervezet válaszreakcióján alapuló ellenanyag kimutatáson, vagy - ha lehetséges - szövetkultúrában történő tenyésztésen alapszik. A cytopátiás hatás esetén a vírus azonosítása további időigényes módszerek alkalmazásán alapszik. Ma már az antigén kimutatási, valamint nukleinsav amplifikáción (PCR) alapú módszerek lehetőséget biztosítanak a vírusinfekciók gyors igazolására is, de ebben az esetben is speciális laboratóriumi technikára van szükség. Az itt következő oktatási anyagban a MALDI-TOF MS módszer ismertetésére kerül sor, mely az elmúlt 10 évben forradalmasította a rutin klinikai mikrobiológiai laboratóriumokban a baktériumok/gombák különböző szintű azonosítását (genus, species, subspecies). Ez a protein alapú módszer nem csak a gyors (néhány percen belüli) species meghatározás lehetőségét teremtette meg a 16S rRNS gén szekvenálásnak megfelelő specificitással, de lehetőséget biztosít a baktériumok virulencia faktorainak vizsgálatára, az antibiotikum rezisztencia detektálására, vizsgálati anyagban direkt species azonosításra, vírusdetektálásra és a további alkalmazások lehetősége ma még beláthatatlan. A módszer klinikai mikrobiológiai alkalmazásával kapcsolatos publikációk száma az elmúlt 20 évben rohamosan nőtt.

Tétel nézet